仙堂寺现为三进院落，中轴线由低向高，层层向上，整个建筑，布局独特完整，错落有致，从沟底登162级天梯到达山门，两侧设钟鼓二楼。前院东设关圣殿（关公赤面美髯，关平、周仓持刀侍奉），西为乐楼。前院拾级而上进入中院寺门。中殿面阔三间进深两间，五踩斗拱，单檐歇山顶，现辟为法显纪念馆。两侧为东西配殿，各五间。由两侧拾级而上到后院，中为三佛殿，面阔三间，进深两间，斗拱五铺作，单檐歇山顶，保留着宋代建筑风格，两侧设东西配殿。西南角设大殿，寺内现存药师佛、枷蓝佛、燃灯佛、释迦牟尼佛、弥勒佛等彩色塑像，均为明代遗物。留有记载仙堂寺之僧建斯功德的宋代碑刻，明、清、民国寺院重修碑记及经幢3通。 
