太阳蕊根吉喏：太阳蕊胜利宝是萨迦寺的四大奇宝之一，为世界上最大的铜铸宝幢，高十米，重一万余公斤，内装消灾伏魔经典，众多大成就者的舍利等宝物。是祷祝世界和平、风调雨顺、众生安乐最有力的法器。是饱含佛法兴盛与教派宗门强盛意蕴的殊胜宝物。
月光根吉喏：位于大殿后楼顶部，装有龙蛋，每当大雨来临，阴霾遍空时。萨迦的能见度非常低，此宝幢会变成如烈火煅烧般的深红色，呈现半透明的虹光，同时能于此宝幢上方见到闪电以及听到滋滋的电流声，仿佛是寺院的避雷针一般。
（殿外屋檐 右上方为月光根吉喏）
(拉康孜)
孜贡康（秘密护法殿）：民间有言，“噶厦政府有权，萨迦有护法，不怕萨迦的人，怕萨迦的护法。”说明萨迦护法的威神力，西北角是萨迦秘密护法殿，此殿主供白石大黑天。大黑天护法雕塑在修筑的时候，展现神迹挡住了拔地而起的大风，并把白石嵌入了佛像心间。因此又称为白石大黑天。
此殿左边是吉祥天母，右边为帐面玛哈嘎拉。外殿供有尸陀林主与萨迦巴姆色吉、香雄多吉普尺主尊能嗄卓越玛等。诸护法在超度魔鬼方面具有无比超拔的法力。喇嘛们每月初九、十九、二十九日前来诵经和举办超度法会。
喇嘛拉康：此殿主供阿旺贡嘎仁钦药泥如意宝等传承上师法相。坐东朝西有极乐世界图，有萨班亲自绘制的桑耶寺壁画。还有阿羌贡嘎仁钦背朝墙所描画的与萨班一致的桑耶寺壁画圣僧图（法王说此壁画工艺上不算特别完美，因为在夜晚背画而成，颜料不均匀，色彩不具足。但是对寺院有特殊吉祥的缘起）。正南面有阿羌贡嘎仁钦做甘露丸加持的洞，洞里以前有从印度大成就者嘎亚达拉传下来的紫铜宝瓶甘露水，可洗除一切障碍。
关于“哎哟佛”的故事比较有趣。萨迦法王在维修寺院时，此佛像被不慎断落得房梁压到右肩，发出了“哎哟”一声。觉沃佛已经远离妄念无痛无灾，但为了提醒修建工人小心，而发出此声。觉沃佛前为布扎拉错，意为“布扎护法的魂湖”。法王八思巴从内地回拉萨时，从康区德格的热登寺的供奉中挑选了这口大钢锅。八思巴将大锅装满长江水，运送到萨迦，并赋予大锅显现来生后世的神通。
慧海经山经书墙：萨迦寺慧海经山，是公元十三世纪法王八思巴时期于幻化大雄宝殿所建的语所依。所有经文皆用金、银、珊瑚、象牙、海螺、珍珠及各种珍贵宝石研成墨汁，在质地为青蓝色和黄色的传统藏纸上书写而成。技术长至两米，最小四五十公分，内容是佛陀的经典大藏经《甘珠尔》、《丹珠尔》等各式文化论典，浩如烟海。谚语有云：“萨迦寺外墙可动，慧海经山内墙不会动。”
经书墙中最著名的是经书《博德甲轮马》，经书宽一米长二米，为现行世界最大的经书，因其上下夹板由珍贵的木材制成，且嵌有八个铁环，又称铁环经书。铁环经书由度母化身的一位老阿妈写就。内容为般若八千颂，字体笔画粗如八岁儿童手指。是为萨迦寺四大奇宝之一。
白海螺法号：“源于龙王威德，声扬梵天妙音，世尊转法轮时，帝释殷勤奉献。”《颂萨迦诗集》中如是写道。萨迦大白海法螺号乃是佛陀驻世时期所用，为真实具力之法物。白海螺最初用印度国王达玛巴拉赠与中国大皇帝忽必烈陛下，而后为感谢法王八思巴授予喜金刚灌顶之恩，特虔诚奉上，从此传于萨迦。作为萨迦镇寺之宝的白海螺法号，与圣地拉萨大昭寺的见解脱觉沃佛像被称为西藏两大珍宝，是藏地百姓的精神之依止。
欧东仁增拉康：此拉康的北殿为欧东强嘛殿，有着近千年的神奇壁画，历代萨迦法王经师们的外所依灵塔塔亦供奉于此。六座灵塔依次分别为：拉钦贡嘎罗珠、夏尔巴推果哇庆波、夏尔巴蒋扬仁钦坚赞、 帝师扎巴俄色、帝师桑杰巴、确吉阿旺南加。二十世纪四十年代这些灵塔与对应的法器一起从北寺迎请至南寺，保存至今。此殿主供奉阿羌贡嘎仁钦灵塔。大殿右边第一座即是他的真身灵塔。
主殿内还依次供奉着阿羌贡嘎旺迦、嘎钦图多旺秋、索南旺秋、贡嘎索南、阿羌贡嘎扎西、索南仁钦、贡嘎洛珠、温顿宁波等法王尊胜塔。南墙的壁画上，描绘了三次维修的情况。西面的佛龛中供养着各教派上师的著作与论典。
慈久拉康：此殿是卓玛颇章历代法王的灵塔所在地。每月初十、二十五要举行供奉法会。殿内主供能言莲花生大师，是昆式桑卫达波的内所依，萨迦法王白玛堆都旺秋的银质尊胜灵塔。左边是法王巴钦俄布能言银质佛像（莲花生大师的胜伏三界像），佛像两侧是两尊银质纳诺卡雀佛母。以前供奉在平措法王的卡雀空行母殿内。殿内还供有持钦扎西仁钦内、措钦贡嘎宁波、察秀赤烈仁钦等的菩提塔、阿旺贡嘎仁钦的内所依尊胜塔。此塔是现今住世的文殊化身萨迦大乘法王的父亲之塔。
殿内坐西朝东的壁画绘有莲花生大师的传记。坐西朝东的壁画绘有长寿佛，寓意法王长久驻世与弘法事业的缘起。
出了慈久拉康即是解脱梯。四十一级解脱梯是从萨迦巴钦颇章掘出的伏藏品。后萨迦工匠尼玛扎西于梯上附着了铁皮。起到了加固与保护的作用。沿着梯子一口气抵达拉康孜，具有解脱的吉祥缘起。
(解脱梯)
大殿内有四大名柱，分别为：黑流血柱、忽必烈柱、野牛柱、老虎柱。其中忽必烈柱为忽必烈薛禅汗为感恩法王八思巴所供养，特设此柱，此柱高六点六米，柱周长四米；其余三柱为龙（独二那波）、玛哈嘎拉护法神等神灵加持融入的大树所铸成。
大殿坐东朝西的书架上，有法王八思巴的母亲冯吉贡杰所建的意所依部分大藏经。坐南朝北的书架上，有荣措丹增桑莫为令萨迦世袭不间断，倾家荡产而修建的部分大藏经，书架后能看见慧海经山的一角。书架旁和爱旺桑宝的内所依灵塔。大殿内坐南朝北的第一尊佛为能仁佛，是萨迦本钦释迦桑博得意所依能仁佛陀像，内装饮光佛的牙舍利与法衣袈裟。而后是银质十一面观音像。坐西朝东的眉间右旋白海螺世尊像、莲花生大师像、阿旺陀多旺秋的灵塔。其中阿旺陀多旺秋的金质灵塔中藏有法王的头盖骨与萨班鼻血绘制成的萨班像，以及藏文创始人土羡桑布扎亲手写的《十万般若十二部》经典。塔门中屹立的是纯金的多杰羌阿旺陀多旺秋的等身像。是当今萨迦达钦法王阿旺贡嘎索南的父亲。阿旺陀多旺秋的灵塔旁边是贡嘎宁波能言等身像，此像由萨钦亲自铸造并开光，大慈萨钦圆寂后从昂仁县迎回萨迦寺。而后是陀旺拉钦八巴（威光大佛），此像乃八思巴内所依，由达玛巴拉所建。再旁边是亲见面授阿修罗风格莲师像。此像前面是喇嘛当巴索朗坚赞的等身像旁边是扎巴麻疯像。扎巴麻疯像是由至尊扎巴坚赞四大弟子之一的嘎敦释迦扎修所建。内含萨迦附近流传的麻风病因，此像建成后抽离了萨迦百姓的麻风病痛。在此像左侧是桑宝巴德等身像和萨迦历代昆式家族的见利益宝座，此宝座是文殊化身的昆氏家族所独有。而后是为法王长久驻世而修建的银质长寿三尊像。像前是胜辨文殊像。胜辨文殊像是萨迦 ? 班智达在吉隆县与六位印度外道者辨经时得胜所建。旁边有一尊站立度母像，是卡什班钦的意所依，左边是萨迦 ? 班智达母亲尼知蒋的内所依：能净度母像。度母像前有萨迦白衣三祖像和熄火文殊像。熄火文殊菩萨是特钦曲加法王的内所依。左边是强巴佛。是至尊白久羡佛母的内所依。再左侧是玛巴拉法王的所依金刚总持。
(吉祥萨迦幻化大雄宝殿)
萨迦寺位于后藏日喀则地区萨迦古城，海拔四千三百一十六米，为藏传佛教萨迦派祖庭。萨迦南北两寺占地面积巨大，建筑结构独特。北寺是光明昆式家族、传承吐蕃文明的七天王之一、昆鲁王松瓦的后代（从光明昆式、无垢昆式传至萨迦昆式家族）昆 ? 贡却杰布所创建。作为萨迦巴的创始人，昆 ? 贡却杰布当时买下来本波山东侧大黑天眷属聚集地与西侧巴姆夜间聚会地巴卓之间的地方，经由申请地方总管觉悟东那巴同意，降雄古拉瓦等各块土地主人供养，因缘聚合。萨迦寺于藏历第一轮水牛年初日（1073年）开始兴建。从此萨迦历代法王在此弘扬圣教，大兴佛事，于数百年间次第兴建了四大拉章等一百零八座殿堂。极大的拓展了寺院的规模。同时还培养了众多的僧尼等佛教人才，成为众生的福德所依。
其中萨迦南寺主要建筑群有：
幻化大雄宝殿（拉康钦莫大殿）、胜利宝瓶（根吉仁）与双孔雀标志、东典拉康、普巴拉康、世界光明灵塔、慧海经山经书墙、欧东仁增拉康、慈久拉康、拉康孜、秘密护法殿（孜贡康）、喇嘛拉康、胜利宝（根吉喏）、护法殿（拉章贡康）、拉康拉章大殿、讲经院、角楼殿（八处）、慈钦拉康。
